Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP22Q9UPT9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP22Q9UPT9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1435.7 ms