Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC8A2Q9UPR5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC8A2Q9UPR5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms