Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
TRIM35Q9UPQ4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
TRIM35Q9UPQ4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM35Q9UPQ4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms