Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX6Q9UNH7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX6Q9UNH7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX6Q9UNH7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms