Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYNRGQ9UMZ2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYNRGQ9UMZ2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms