Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCC3Q9ULS5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms