Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXNB3Q9ULL4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms