Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DENND2AQ9ULE3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms