Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PNMA3Q9UL41 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNMA3Q9UL41 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PNMA3Q9UL41 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms