Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH22Q9UJ99 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms