Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
STAG3Q9UJ98 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
STAG3Q9UJ98 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
STAG3Q9UJ98 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
STAG3Q9UJ98 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
STAG3Q9UJ98 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
STAG3Q9UJ98 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
STAG3Q9UJ98 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
STAG3Q9UJ98 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
STAG3Q9UJ98 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
STAG3Q9UJ98 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
STAG3Q9UJ98 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
STAG3Q9UJ98 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
STAG3Q9UJ98 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
STAG3Q9UJ98 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
STAG3Q9UJ98 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
STAG3Q9UJ98 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
STAG3Q9UJ98 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
STAG3Q9UJ98 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
STAG3Q9UJ98 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms