Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ABCF2Q9UG63 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCF2Q9UG63 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCF2Q9UG63 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCF2Q9UG63 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms