Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS7AQ9UBW8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS7AQ9UBW8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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