Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF12Q9NZN5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGEF12Q9NZN5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF12Q9NZN5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms