Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRN3Q9NYV6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRN3Q9NYV6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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