Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXX6

NSMCE4A, Non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE4AQ9NXX6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE4AQ9NXX6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE4AQ9NXX6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms