Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL28Q9NXS3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL28Q9NXS3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms