Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ING3Q9NXR8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ING3Q9NXR8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms