Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
THUMPD1Q9NXG2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms