Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXD2Q9NVH0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms