Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKDREJQ9NTG1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKDREJQ9NTG1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms