Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM7Q9NQW5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms