Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM8Q9NQV8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM8Q9NQV8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms