Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 NPM1-211ENST00000523622 247 ntTSL 36.42□□□□□ -1.383e-8■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.533e-8■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 NPM1-205ENST00000518587 670 ntTSL 25.52□□□□□ -1.533e-8■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.623e-8■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 NPM1-210ENST00000523339 268 ntTSL 23.51□□□□□ -1.853e-8■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.777e-7■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.877e-7■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.087e-7■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 HSF2-203ENST00000465214 642 ntTSL 23.81□□□□□ -1.81e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP4K4-220ENST00000627726 3135 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP4K4-211ENST00000427603 526 ntTSL 47.64□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 MAP4K4-207ENST00000417294 4251 ntTSL 55.59□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM56-203ENST00000456991 992 ntTSL 317.27■□□□□ 0.369e-7■■■■■ 32.8
EXOSC5Q9NQT4 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.569e-7■■■■■ 32.8
EXOSC5Q9NQT4 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.649e-7■■■■■ 32.8
EXOSC5Q9NQT4 TMEM56-202ENST00000455656 609 ntTSL 59.33□□□□□ -0.929e-7■■■■■ 32.8
EXOSC5Q9NQT4 TMEM56-RWDD3-201ENST00000604203 680 ntTSL 35.6□□□□□ -1.519e-7■■■■■ 32.8
EXOSC5Q9NQT4 PDE3B-203ENST00000525439 693 ntTSL 32.5□□□□□ -2.011e-8■■■■■ 32.8
EXOSC5Q9NQT4 LMBR1-218ENST00000486837 576 ntTSL 24.76□□□□□ -1.659e-7■■■■■ 32.8
EXOSC5Q9NQT4 WDR89-203ENST00000554717 976 ntTSL 27.74□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 32.8
EXOSC5Q9NQT4 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 32.8
EXOSC5Q9NQT4 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.563e-6■■■■■ 32.8
EXOSC5Q9NQT4 LRP12-202ENST00000424843 4092 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 32.7
EXOSC5Q9NQT4 LRP12-205ENST00000520770 853 ntTSL 1 (best)7.97□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 32.7
EXOSC5Q9NQT4 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 32.7
EXOSC5Q9NQT4 LRP12-204ENST00000519675 5008 ntTSL 26.43□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 32.7
EXOSC5Q9NQT4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 32.7
EXOSC5Q9NQT4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 32.7
EXOSC5Q9NQT4 STK3-203ENST00000517832 594 ntTSL 37.22□□□□□ -1.251e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 SNX13-211ENST00000496855 1499 ntTSL 1 (best)4.76□□□□□ -1.651e-8■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 TYW1B-201ENST00000610600 1086 ntTSL 211.4□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 TYW1B-202ENST00000612372 1543 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.061e-8■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.351e-8■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.444e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 SCFD1-201ENST00000311943 2016 ntTSL 29.54□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 SCFD1-206ENST00000484733 2308 ntTSL 58.98□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 SCFD1-215ENST00000555259 1553 ntTSL 1 (best)8.17□□□□□ -1.14e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 SCFD1-202ENST00000396629 2021 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.284e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 SCFD1-222ENST00000556768 1829 ntTSL 1 (best)5.7□□□□□ -1.54e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 SCFD1-205ENST00000469043 696 ntTSL 24.8□□□□□ -1.644e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 SCFD1-221ENST00000556534 864 ntTSL 54.19□□□□□ -1.744e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 SCFD1-223ENST00000557076 743 ntTSL 34.13□□□□□ -1.754e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.84e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 SCFD1-210ENST00000553693 490 ntTSL 33.19□□□□□ -1.94e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 SCFD1-213ENST00000554776 583 ntTSL 53.11□□□□□ -1.914e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 SCFD1-204ENST00000463622 1943 ntTSL 22.93□□□□□ -1.944e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 POLK-211ENST00000508867 2464 ntTSL 1 (best)8.14□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 POLK-209ENST00000507073 629 ntTSL 35.82□□□□□ -1.482e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.532e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 POLK-215ENST00000514141 4345 ntTSL 1 (best)5.18□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 POLK-214ENST00000511527 1594 ntTSL 24.92□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 POLK-212ENST00000509126 2441 ntTSL 23.65□□□□□ -1.832e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.842e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 POLK-207ENST00000505975 2727 ntTSL 23.45□□□□□ -1.862e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.872e-7■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 NAP1L4-205ENST00000455338 352 ntTSL 51.98□□□□□ -2.091e-9■■■■■ 32.6
EXOSC5Q9NQT4 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.98e-8■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.058e-8■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.068e-8■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.098e-8■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.178e-8■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 HOOK3-204ENST00000527306 2325 ntTSL 1 (best)18.91■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 VPS13B-211ENST00000522802 570 ntTSL 35.38□□□□□ -1.553e-7■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 BRD9-212ENST00000495265 2843 ntTSL 215.57■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 BRD9-208ENST00000489816 3170 ntTSL 1 (best)13.62□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 BRD9-201ENST00000466684 1417 ntTSL 213.11□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 BRD9-213ENST00000495794 4865 ntTSL 212.69□□□□□ -0.382e-8■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 BRD9-218ENST00000519838 396 ntTSL 210.74□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 BRD9-204ENST00000483173 2120 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 BRD9-203ENST00000475706 744 ntTSL 1 (best)9.17□□□□□ -0.942e-8■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 BRD9-209ENST00000490814 3477 ntTSL 1 (best)8.96□□□□□ -0.982e-8■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 BRD9-211ENST00000494422 449 ntTSL 35.29□□□□□ -1.562e-8■■■■■ 32.5
EXOSC5Q9NQT4 CEP192-208ENST00000510237 6548 ntTSL 1 (best)7.67□□□□□ -1.188e-7■■■■■ 32.4
EXOSC5Q9NQT4 CEP192-209ENST00000511820 6455 ntTSL 1 (best)5.7□□□□□ -1.58e-7■■■■■ 32.4
EXOSC5Q9NQT4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 32.4
EXOSC5Q9NQT4 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.564e-7■■■■■ 32.4
EXOSC5Q9NQT4 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 32.4
EXOSC5Q9NQT4 ATL2-203ENST00000405384 1905 ntTSL 1 (best)11.07□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 32.4
EXOSC5Q9NQT4 ATL2-206ENST00000419554 2335 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 32.4
EXOSC5Q9NQT4 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.884e-7■■■■■ 32.4
EXOSC5Q9NQT4 MAST2-205ENST00000470809 640 ntTSL 34.26□□□□□ -1.736e-7■■■■■ 32.4
EXOSC5Q9NQT4 RAD51B-203ENST00000468382 829 ntTSL 55.04□□□□□ -1.67e-7■■■■■ 32.4
EXOSC5Q9NQT4 COG5-208ENST00000475638 592 ntTSL 34.97□□□□□ -1.615e-7■■■■■ 32.3
EXOSC5Q9NQT4 CCDC66-211ENST00000468108 567 ntTSL 44.34□□□□□ -1.714e-7■■■■■ 32.3
EXOSC5Q9NQT4 CABIN1-210ENST00000484593 561 ntTSL 38.39□□□□□ -1.077e-8■■■■■ 32.3
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