Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CD93Q9NPY3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD93Q9NPY3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD93Q9NPY3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD93Q9NPY3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CD93Q9NPY3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD93Q9NPY3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD93Q9NPY3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD93Q9NPY3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD93Q9NPY3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms