Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM138Q9NPI0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms