Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK9Q9NPC2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms