Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF408Q9H9D4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF408Q9H9D4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms