Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C10orf88Q9H8K7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C10orf88Q9H8K7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C10orf88Q9H8K7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms