Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCAF1Q9H7N4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCAF1Q9H7N4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCAF1Q9H7N4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCAF1Q9H7N4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCAF1Q9H7N4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCAF1Q9H7N4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCAF1Q9H7N4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCAF1Q9H7N4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCAF1Q9H7N4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCAF1Q9H7N4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SCAF1Q9H7N4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SCAF1Q9H7N4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SCAF1Q9H7N4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SCAF1Q9H7N4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SCAF1Q9H7N4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SCAF1Q9H7N4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SCAF1Q9H7N4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SCAF1Q9H7N4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SCAF1Q9H7N4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms