Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP13A3Q9H7F0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A3Q9H7F0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms