Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C5orf42Q9H799 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C5orf42Q9H799 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms