Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCAS3Q9H6U6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms