Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOJQ9H4E5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms