Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX5Q9H2C1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX5Q9H2C1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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