Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
USP44Q9H0E7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms