Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NACA2Q9H009 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NACA2Q9H009 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NACA2Q9H009 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NACA2Q9H009 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NACA2Q9H009 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NACA2Q9H009 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NACA2Q9H009 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NACA2Q9H009 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NACA2Q9H009 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NACA2Q9H009 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NACA2Q9H009 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NACA2Q9H009 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms