Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP6Q9GZR1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP6Q9GZR1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP6Q9GZR1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP6Q9GZR1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP6Q9GZR1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP6Q9GZR1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP6Q9GZR1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP6Q9GZR1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP6Q9GZR1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP6Q9GZR1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP6Q9GZR1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP6Q9GZR1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP6Q9GZR1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP6Q9GZR1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP6Q9GZR1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP6Q9GZR1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP6Q9GZR1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms