Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
B3GNT4Q9C0J1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
B3GNT4Q9C0J1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms