Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIPCQ9C0C6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms