Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM5Q9C035 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM5Q9C035 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms