Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXQ1Q9C009 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXQ1Q9C009 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms