Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPRY4Q9C004 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRY4Q9C004 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRY4Q9C004 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms