Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC61Q9BV99 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC61Q9BV99 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC61Q9BV99 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC61Q9BV99 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.2 ms