Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDC1Q9BTX1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDC1Q9BTX1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms