Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNPY3Q9BT09 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms