Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PYM1Q9BRP8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PYM1Q9BRP8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PYM1Q9BRP8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PYM1Q9BRP8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PYM1Q9BRP8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PYM1Q9BRP8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PYM1Q9BRP8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PYM1Q9BRP8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PYM1Q9BRP8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PYM1Q9BRP8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PYM1Q9BRP8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PYM1Q9BRP8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PYM1Q9BRP8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PYM1Q9BRP8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PYM1Q9BRP8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PYM1Q9BRP8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PYM1Q9BRP8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PYM1Q9BRP8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PYM1Q9BRP8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms