Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBA1CQ9BQE3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA1CQ9BQE3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms