Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGPAT1Q99943 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGPAT1Q99943 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms