Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GPA33Q99795 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GPA33Q99795 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GPA33Q99795 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GPA33Q99795 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPA33Q99795 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GPA33Q99795 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GPA33Q99795 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPA33Q99795 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPA33Q99795 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPA33Q99795 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPA33Q99795 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPA33Q99795 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPA33Q99795 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPA33Q99795 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPA33Q99795 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPA33Q99795 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GPA33Q99795 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPA33Q99795 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPA33Q99795 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPA33Q99795 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPA33Q99795 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPA33Q99795 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPA33Q99795 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPA33Q99795 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPA33Q99795 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GPA33Q99795 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GPA33Q99795 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GPA33Q99795 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPA33Q99795 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPA33Q99795 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPA33Q99795 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPA33Q99795 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPA33Q99795 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPA33Q99795 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPA33Q99795 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPA33Q99795 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPA33Q99795 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPA33Q99795 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GPA33Q99795 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPA33Q99795 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPA33Q99795 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPA33Q99795 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPA33Q99795 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPA33Q99795 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPA33Q99795 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPA33Q99795 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPA33Q99795 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPA33Q99795 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPA33Q99795 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPA33Q99795 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPA33Q99795 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPA33Q99795 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPA33Q99795 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPA33Q99795 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPA33Q99795 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPA33Q99795 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms